João Vieira Ribeiro

Процитировано

	Все	Начиная с 2019 г.
Статистика цитирования	2914	2784
h-индекс	11	10
i10-индекс	11	10

780

390

195

585

2013201420152016201720182019202020212022202320248 10 11 18 23 37 59 102 435 653 757 771

Общий доступ

Просмотреть все

7 статей

1 статья

доступно

недоступно

На основе финансирования

Соавторы

Klaus SchultenProfessor of Physics, University of Illinois at Urbana-ChampaignПодтвержден адрес электронной почты в домене ks.uiuc.edu
John E. StoneDistinguished Engineer, Scientific Visualization DevTech, NVIDIA CorporationПодтвержден адрес электронной почты в домене nvidia.com
Rafael C BernardiAssociate Professor - Department of Physics at Auburn UniversityПодтвержден адрес электронной почты в домене auburn.edu
James C PhillipsSenior Research Programmer, National Center for Supercomputing Applications, University of IllinoisПодтвержден адрес электронной почты в домене illinois.edu
Till RudackRuhr University BochumПодтвержден адрес электронной почты в домене rub.de
Lydia FreddolinoAssociate ProfessorПодтвержден адрес электронной почты в домене umich.edu
Nuno M. F. S. A. CerqueiraRequimte, Faculdade de Ciências, Universidade do PortoПодтвержден адрес электронной почты в домене fc.up.pt
Barry IsralewitzPost-Doctoral Research Associate, Theoretical and Computational Biophysics Group, University ofПодтвержден адрес электронной почты в домене ks.uiuc.edu
Angela M. BarragánNorthwestern UniversityПодтвержден адрес электронной почты в домене northwestern.edu
Kirby VandivortUniversity of Illinois at Urbana-ChampaignПодтвержден адрес электронной почты в домене uiuc.edu
Boon Chong GohSingapore-MIT Alliance for Research and TechnologyПодтвержден адрес электронной почты в домене ks.uiuc.edu
Irina S. MoreiraUniversity of Coimbra, Life Sciences Department; Center for Neuroscience and Cell BiologyПодтвержден адрес электронной почты в домене cnc.uc.pt
Bo LiuBeihang UniversityПодтвержден адрес электронной почты в домене buaa.edu.cn

João Vieira Ribeiro

Moderna Therapeutics

Подтвержден адрес электронной почты в домене modernatx.com

Molecular Dynamics Software Development Molecular Visualization Molecular Modeling


Название По числу цитат По году По названию	Процитировано Процитировано	Год
Scalable molecular dynamics on CPU and GPU architectures with NAMD JC Phillips, DJ Hardy, JDC Maia, JE Stone, JV Ribeiro, RC Bernardi, ... The Journal of chemical physics 153 (4), 2020	2249	2020
NAMD goes quantum: an integrative suite for hybrid simulations MCR Melo, RC Bernardi, T Rudack, M Scheurer, C Riplinger, JC Phillips, ... Nature methods 15 (5), 351-354, 2018	213	2018
QwikMD—integrative molecular dynamics toolkit for novices and experts JV Ribeiro, RC Bernardi, T Rudack, JE Stone, JC Phillips, PL Freddolino, ... Scientific reports 6 (1), 26536, 2016	204	2016
Predicting the structural basis of targeted protein degradation by integrating molecular dynamics simulations with structural mass spectrometry T Dixon, D MacPherson, B Mostofian, T Dauzhenka, S Lotz, D McGee, ... Nature communications 13 (1), 5884, 2022	48	2022
Atomic detail visualization of photosynthetic membranes with GPU-accelerated ray tracing JE Stone, M Sener, KL Vandivort, A Barragan, A Singharoy, I Teo, ... Parallel Computing 55, 17-27, 2016	45	2016
vsLab—An implementation for virtual high‐throughput screening using AutoDock and VMD N Cerqueira, J Ribeiro, PA Fernandes, MJ Ramos International Journal of Quantum Chemistry 111 (6), 1208-1212, 2011	35	2011
Volarea–a bioinformatics tool to calculate the surface area and the volume of molecular systems JV Ribeiro, JAC Tamames, NM Cerqueira, PA Fernandes, MJ Ramos Chemical Biology & Drug Design 82 (6), 743-755, 2013	34	2013
VMD as a platform for interactive small molecule preparation and visualization in quantum and classical simulations M Spivak, JE Stone, J Ribeiro, J Saam, PL Freddolino, RC Bernardi, ... Journal of chemical information and modeling 63 (15), 4664-4678, 2023	25	2023
QwikMD-gateway for easy simulation with VMD and NAMD JV Ribeiro, RC Bernardi, T Rudack, K Schulten, E Tajkhorshid Biophysical Journal 114 (3), 673a-674a, 2018	21	2018
CompASM: an Amber-VMD alanine scanning mutagenesis plug-in JV Ribeiro, NM Cerqueira, IS Moreira, PA Fernandes, MJ Ramos Marco Antonio Chaer Nascimento: A Festschrift from Theoretical Chemistry …, 2014	19	2014
Atomic-resolution prediction of degrader-mediated ternary complex structures by combining molecular simulations with hydrogen deuterium exchange T Dixon, D MacPherson, B Mostofian, T Dauzhenka, S Lotz, D McGee, ... Biorxiv, 2021.09. 26.461830, 2021	12	2021
Business models for academic prototypes: A new approach to media innovation L Nyre, J Ribeiro, B Tessem The Journal of Media Innovations 4 (2), 4-19, 2018	5	2018
Multirep: Asynchronous multi-device consistency J Ribeiro, J Barreto, P Ferreira Proceedings of the Third International Workshop on Middleware for Pervasive …, 2011	3	2011
chem‐path‐tracker: An Automated Tool to Analyze Chemical Motifs in Molecular Structures JV Ribeiro, N Cerqueira, PA Fernandes, MJ Ramos Chemical Biology & Drug Design 84 (1), 44-53, 2014	1	2014
NAMD 2.13 and beyond: New features, larger systems, and faster GPU simulations J Maia, D Hardy, B Radak, J Ribeiro, J Stone, E Tajkhorshid ABSTRACTS OF PAPERS OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 258, 2019		2019
Accessible molecular modeling environment with VMD and NAMD J Ribeiro, E Tajkhorshid ABSTRACTS OF PAPERS OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 258, 2019		2019
QwikMD–easy and fast molecular dynamics simulations with VMD and NAMD JV Ribeiro, RC Bernardi, T Rudack, K Schulten, E Tajkhorshid MDPI AG, 2017		2017
Making Classical and Hybrid (QM/MM) Molecular Dynamics Easy and Fast with QwikMD JV Ribeiro, RC Bernardi, T Rudack, K Schulten Biophysical Journal 112 (3), 448a, 2017		2017
Easy and Fast Setup of Molecular Dynamics Simulations: Combining VMD and NAMD for Experimentalists JV Ribeiro, RC Bernardi, T Rudack, K Schulten Biophysical Journal 110 (3), 641a, 2016		2016
Usage of Poly (NIPAm) in the biofuel production J Ribeiro, R Bernardi, K Schulten ABSTRACTS OF PAPERS OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 249, 2015		2015

В данный момент система не может выполнить эту операцию. Повторите попытку позднее.

Статьи 1–20

Ссылок за год

Повторяющиеся цитирования

Объединенные цитирования

СоавторыСоавторы

Подписаться

Процитировано

Соавторы