Benedict Paten

Cytowane przez

	Wszystkie	Od 2020
Cytowania	52907	36092
h-indeks	82	75
i10-indeks	164	151

10000

5000

2500

7500

2007200820092010201120122013201420152016201720182019202020212022202320242025208 586 623 704 800 994 961 1093 1078 1535 2008 2460 3409 4155 5566 6688 8107 9582 1871

Dostęp publiczny

Wyświetl wszystko

163 artykuły

1 artykuł

dostępne

niedostępne

Objęte finansowaniem

Współautorzy

David HausslerScientific Director, UC Santa Cruz Genomics Institute, University of California, Santa CruzZweryfikowany adres z soe.ucsc.edu
Miten JainAssistant Professor, Northeastern UniversityZweryfikowany adres z northeastern.edu
Jordan M EizengaPostdoctoral Researcher, Genomics Institute, University of California Santa CruzZweryfikowany adres z ucsc.edu
Karen H MigaAssistant Professor; Associate Director, UC Santa Cruz Genomics Institute, University of CaliforniaZweryfikowany adres z ucsc.edu
Mark DiekhansUniversity of California, Santa Cruz; UC Santa Cruz Genomics InstituteZweryfikowany adres z soe.ucsc.edu
Mark AkesonProfessor of Biomolecular Engineering, UC Santa CruzZweryfikowany adres z soe.ucsc.edu
Ian Fiddes10x GenomicsZweryfikowany adres z 10xgenomics.com
Ewan BirneyDirector, EMBL-EBIZweryfikowany adres z ebi.ac.uk
Daniel ZerbinoMosaic TherapeuticsZweryfikowany adres z mosaic-tx.com
Dent EarlStaff Software Engineer at Google. Formerly of UCSC, UCLA.Zweryfikowany adres z soe.ucsc.edu
Ngan NguyenAtreca Inc.Zweryfikowany adres z atreca.com
W James KentUC Santa Cruz Genomics Institute, University of California Santa Cruz, UCSC Genome BrowserZweryfikowany adres z soe.ucsc.edu
Ian HolmesProfessor, Computational Biology and Bioengineering, UC BerkeleyZweryfikowany adres z berkeley.edu
Paul FlicekThe Jackson Laboratory, University of CambridgeZweryfikowany adres z jax.org
laurence ettwiller, Ph.DNew England Biolabs, INCZweryfikowany adres z neb.com
John St. JohnMachine Learning Scientist @ NvidiaZweryfikowany adres z nvidia.com

Obserwuj

Benedict Paten

Professor; Associate Director, UC Santa Cruz Genomics Institute, University of California

Zweryfikowany adres z ucsc.edu - Strona główna

computational genomics sequence analysis genome comparison human variation cancer genomics


Tytuł Sortuj wg cytatów Sortuj wg roku Sortuj wg tytułu	Cytowane przez Cytowane przez	Rok
Identification and analysis of functional elements in 1% of the human genome by the ENCODE pilot project Management Group Liefer Laura A. 51 Wetterstrand Kris A. 51 Good Peter J. 51 ... nature 447 (7146), 799-816, 2007	6124	2007
Genetic effects on gene expression across human tissues GT Consortium, DA Laboratory Nature 550 (7675), 204-213, 2017	3610*	2017
GENCODE reference annotation for the human and mouse genomes A Frankish, M Diekhans, AM Ferreira, R Johnson, I Jungreis, J Loveland, ... Nucleic acids research 47 (D1), D766-D773, 2019	3001	2019
The complete sequence of a human genome S Nurk, S Koren, A Rhie, M Rautiainen, AV Bzikadze, A Mikheenko, ... Science 376 (6588), 44-53, 2022	2639	2022
Towards complete and error-free genome assemblies of all vertebrate species A Rhie, SA McCarthy, O Fedrigo, J Damas, G Formenti, S Koren, ... Nature 592 (7856), 737-746, 2021	2263	2021
Nanopore sequencing and assembly of a human genome with ultra-long reads M Jain, S Koren, KH Miga, J Quick, AC Rand, TA Sasani, JR Tyson, ... Nature biotechnology 36 (4), 338-345, 2018	2049	2018
The Oxford Nanopore MinION: delivery of nanopore sequencing to the genomics community M Jain, HE Olsen, B Paten, M Akeson Genome biology 17, 1-11, 2016	1830	2016
Expanded encyclopaedias of DNA elements in the human and mouse genomes JE Moore, MJ Purcaro, HE Pratt, CB Epstein, N Shoresh, J Adrian, T Kawli, ... Nature 583 (7818), 699-710, 2020	1584	2020
A user’s guide to the encyclopedia of DNA elements (ENCODE) ENCODE Project Consortium PLoS Biol 9 (4), e1001046, 2011	1499	2011
Toil enables reproducible, open source, big biomedical data analyses J Vivian, AA Rao, FA Nothaft, C Ketchum, J Armstrong, A Novak, J Pfeil, ... Nature biotechnology 35 (4), 314-316, 2017	1157	2017
GENCODE 2021 A Frankish, M Diekhans, I Jungreis, J Lagarde, JE Loveland, JM Mudge, ... Nucleic acids research 49 (D1), D916-D923, 2021	1105	2021
The UCSC genome browser database: 2015 update KR Rosenbloom, J Armstrong, GP Barber, J Casper, H Clawson, ... Nucleic acids research 43 (D1), D670-D681, 2015	1101	2015
Improved data analysis for the MinION nanopore sequencer M Jain, IT Fiddes, KH Miga, HE Olsen, B Paten, M Akeson Nature methods 12 (4), 351-356, 2015	818	2015
Assemblathon 2: evaluating de novo methods of genome assembly in three vertebrate species KR Bradnam, JN Fass, A Alexandrov, P Baranay, M Bechner, I Birol, ... GigaScience 2 (1), 2047-217X-2-10, 2013	812	2013
Telomere-to-telomere assembly of a complete human X chromosome KH Miga, S Koren, A Rhie, MR Vollger, A Gershman, A Bzikadze, ... Nature 585 (7823), 79-84, 2020	770	2020
Discovery of functional elements in 12 Drosophila genomes using evolutionary signatures A Stark, MF Lin, P Kheradpour, JS Pedersen, L Parts, JW Carlson, ... Nature 450 (7167), 219-232, 2007	725	2007
Variation graph toolkit improves read mapping by representing genetic variation in the reference E Garrison, J Sirén, AM Novak, G Hickey, JM Eizenga, ET Dawson, ... Nature biotechnology 36 (9), 875-879, 2018	688	2018
Nanopore native RNA sequencing of a human poly (A) transcriptome RE Workman, AD Tang, PS Tang, M Jain, JR Tyson, R Razaghi, ... Nature methods 17 (1), 114, 2020	672	2020
A draft human pangenome reference WW Liao, M Asri, J Ebler, D Doerr, M Haukness, G Hickey, S Lu, JK Lucas, ... Nature 617 (7960), 312-324, 2023	662	2023
Assemblathon 1: a competitive assessment of de novo short read assembly methods D Earl, K Bradnam, JS John, A Darling, D Lin, J Fass, HOK Yu, V Buffalo, ... Genome research 21 (12), 2224-2241, 2011	633	2011

Nie można teraz wykonać tej operacji. Spróbuj ponownie później.

Prace 1–20

Cytowania rocznie

Powielone cytowania

Scalone cytowania

Dodaj współautorówWspółautorzy

Obserwuj

Cytowane przez

Współautorzy