Sergey Koren

Cytowane przez

	Wszystkie	Od 2020
Cytowania	61421	42382
h-indeks	76	68
i10-indeks	115	108

11000

5500

2750

8250

201120122013201420152016201720182019202020212022202320242025173 551 1114 1565 1810 2244 3039 3451 4599 5349 7035 8001 9490 10433 1993

Dostęp publiczny

Wyświetl wszystko

108 artykułów

0 artykułów

dostępne

niedostępne

Objęte finansowaniem

Współautorzy

Adam M. PhillippyDirector, Center for Genomics and Data Science Research, NHGRI, NIHZweryfikowany adres z nih.gov
Arang RhieStaff Scientist, NHGRI, NIHZweryfikowany adres z nih.gov
Brian WalenzNHGRI, NIHZweryfikowany adres z nih.gov
Todd J. TreangenAssociate Professor, Department of Computer Science, Rice UniversityZweryfikowany adres z rice.edu
Nicholas BergmanDirector, National Biodefense Analysis and Countermeasures CenterZweryfikowany adres z st.dhs.gov
Mihai PopProfessor of Computer Science, University of Maryland, College ParkZweryfikowany adres z umd.edu
Timothy P. SmithUSDA/ARS U.S. Meat Animal Research CenterZweryfikowany adres z ars.usda.gov
Jason Rafe MillerAssociate Professor of Computer Science, Hood CollegeZweryfikowany adres z hood.edu
Brian OndovYale School of MedicineZweryfikowany adres z yale.edu
Jay GhuryeGoogleZweryfikowany adres z google.com
Derek BickhartResearch Geneticist, USDA ARSZweryfikowany adres z ars.usda.gov
Evan EichlerProfessor of Genome Sciences, University of WashingtonZweryfikowany adres z gs.washington.edu
Granger G. Sutton IIIProfessor of Informatics, J. Craig Venter InstituteZweryfikowany adres z jcvi.org
Konstantin BerlinCiscoZweryfikowany adres z cisco.com
Alexander T DiltheyInstitute of Medical Microbiology, University Hospital of DusseldorfZweryfikowany adres z med.uni-duesseldorf.de
Glennis LogsdonUniversity of PennsylvaniaZweryfikowany adres z pennmedicine.upenn.edu
John L. WilliamsUniversity of Adelaide / Università Cattolica del Sacro CuoreZweryfikowany adres z adelaide.edu.au
Michael C. SchatzBloomberg Distinguished Professor, Johns Hopkins UniversityZweryfikowany adres z cs.jhu.edu
Sergey NurkPrincipal Bioinformatician, Oxford Nanopore TechnologiesZweryfikowany adres z nanoporetech.com
Erich JarvisRockefeller University, Duke University, HHMIZweryfikowany adres z rockefeller.edu

Obserwuj

Sergey Koren

Associate Investigator, NHGRI/NIH

Zweryfikowany adres z nih.gov - Strona główna

Bioinformatics High-performance computing Genome Assembly Computational Biology Computer Science


Tytuł Sortuj wg cytatów Sortuj wg roku Sortuj wg tytułu	Cytowane przez Cytowane przez	Rok
Structure, function and diversity of the healthy human microbiome nature 486 (7402), 207-214, 2012	11052	2012
Canu: scalable and accurate long-read assembly via adaptive k-mer weighting and repeat separation S Koren, BP Walenz, K Berlin, JR Miller, NH Bergman, AM Phillippy Genome research 27 (5), 722-736, 2017	6733	2017
Mash: fast genome and metagenome distance estimation using MinHash BD Ondov, TJ Treangen, P Melsted, AB Mallonee, NH Bergman, S Koren, ... Genome biology 17, 1-14, 2016	2869	2016
The complete sequence of a human genome S Nurk, S Koren, A Rhie, M Rautiainen, AV Bzikadze, A Mikheenko, ... Science 376 (6588), 44-53, 2022	2643	2022
Towards complete and error-free genome assemblies of all vertebrate species A Rhie, SA McCarthy, O Fedrigo, J Damas, G Formenti, S Koren, ... Nature 592 (7856), 737-746, 2021	2266	2021
Merqury: reference-free quality, completeness, and phasing assessment for genome assemblies A Rhie, BP Walenz, S Koren, AM Phillippy Genome biology 21, 1-27, 2020	2166	2020
Nanopore sequencing and assembly of a human genome with ultra-long reads M Jain, S Koren, KH Miga, J Quick, AC Rand, TA Sasani, JR Tyson, ... Nature biotechnology 36 (4), 338-345, 2018	2054	2018
A framework for human microbiome research Nature 486 (7402), 215-221, 2012	1950	2012
Assembly algorithms for next-generation sequencing data JR Miller, S Koren, G Sutton Genomics 95 (6), 315-327, 2010	1648	2010
The Harvest suite for rapid core-genome alignment and visualization of thousands of intraspecific microbial genomes TJ Treangen, BD Ondov, S Koren, AM Phillippy Genome biology 15, 1-15, 2014	1637	2014
Accurate circular consensus long-read sequencing improves variant detection and assembly of a human genome AM Wenger, P Peluso, WJ Rowell, PC Chang, RJ Hall, GT Concepcion, ... Nature biotechnology 37 (10), 1155-1162, 2019	1566	2019
Hybrid error correction and de novo assembly of single-molecule sequencing reads S Koren, MC Schatz, BP Walenz, J Martin, JT Howard, G Ganapathy, ... Nature biotechnology 30 (7), 693-700, 2012	1217	2012
Assembling large genomes with single-molecule sequencing and locality-sensitive hashing K Berlin, S Koren, CS Chin, JP Drake, JM Landolin, AM Phillippy Nature biotechnology 33 (6), 623-630, 2015	1107	2015
Evaluation of GRCh38 and de novo haploid genome assemblies demonstrates the enduring quality of the reference assembly VA Schneider, T Graves-Lindsay, K Howe, N Bouk, HC Chen, PA Kitts, ... Genome research 27 (5), 849-864, 2017	1099	2017
GAGE: A critical evaluation of genome assemblies and assembly algorithms SL Salzberg, AM Phillippy, A Zimin, D Puiu, T Magoc, S Koren, ... Genome Research 22 (3), 557-567, 2012	902	2012
Assemblathon 2: evaluating de novo methods of genome assembly in three vertebrate species KR Bradnam, JN Fass, A Alexandrov, P Baranay, M Bechner, I Birol, ... GigaScience 2 (1), 2047-217X-2-10, 2013	812	2013
Integrating Hi-C links with assembly graphs for chromosome-scale assembly J Ghurye, A Rhie, BP Walenz, A Schmitt, S Selvaraj, M Pop, AM Phillippy, ... PLoS computational biology 15 (8), e1007273, 2019	800	2019
Telomere-to-telomere assembly of a complete human X chromosome KH Miga, S Koren, A Rhie, MR Vollger, A Gershman, A Bzikadze, ... Nature 585 (7823), 79-84, 2020	779	2020
Structure, function and diversity of the healthy human microbiome HMP Consortium nature 486 (7402), 207-214, 2012	700	2012
Aggressive assembly of pyrosequencing reads with mates JR Miller, AL Delcher, S Koren, E Venter, BP Walenz, A Brownley, ... Bioinformatics 24 (24), 2818-2824, 2008	683	2008

Nie można teraz wykonać tej operacji. Spróbuj ponownie później.

Prace 1–20

Cytowania rocznie

Powielone cytowania

Scalone cytowania

Dodaj współautorówWspółautorzy

Obserwuj

Cytowane przez

Współautorzy