Sebastian Duchene

Cytowane przez

	Wszystkie	Od 2020
Cytowania	11721	9621
h-indeks	47	42
i10-indeks	87	81

2200

1100

550

1650

201320142015201620172018201920202021202220232024202533 42 123 220 352 537 686 1320 1955 2189 1889 1884 372

Dostęp publiczny

Wyświetl wszystko

99 artykułów

8 artykułów

dostępne

niedostępne

Objęte finansowaniem

Współautorzy

Simon HoProfessor of Molecular Evolution, University of SydneyZweryfikowany adres z sydney.edu.au
Edward C HolmesUniversity of SydneyZweryfikowany adres z sydney.edu.au
David A. DuchêneAssociate Professor, Department of Public Health, University of CopenhagenZweryfikowany adres z sund.ku.dk
Timothy G VaughanDepartment of Biosystems Science and Engineering, ETH Zürich, SwitzerlandZweryfikowany adres z bsse.ethz.ch
Leo A FeatherstoneThe Peter Doherty Institute for Infection and ImmunityZweryfikowany adres z unimelb.edu.au
Tanja StadlerETH ZurichZweryfikowany adres z env.ethz.ch
Jemma L GeogheganProfessor; Webster Chair, University of Otago; Rutherford Discovery FellowZweryfikowany adres z otago.ac.nz
Remco BouckaertZweryfikowany adres z cs.auckland.ac.nz
Nicola Felix MüllerUniviersity of California San FranciscoZweryfikowany adres z ucsf.edu
François-Xavier WeillProfessor, Institut Pasteur, Paris, FranceZweryfikowany adres z pasteur.fr
Guy BaeleAssociate Professor, KU LeuvenZweryfikowany adres z kuleuven.be
Wytamma WirthThe University of MelbourneZweryfikowany adres z unimelb.edu.au
Ashleigh F PorterCSIROZweryfikowany adres z csiro.au
Phillip A. MorinResearch Molecular Geneticist, Southwest Fisheries Science CenterZweryfikowany adres z noaa.gov
Francesca Di GiallonardoPostdoctoral Research Fellow, University of New South WalesZweryfikowany adres z kirby.unsw.edu.au
Philippe LemeyFull Professor, KU LeuvenZweryfikowany adres z kuleuven.be
M Thomas P GilbertUniversity of CopenhagenZweryfikowany adres z sund.ku.dk
John H TayPeter Doherty Institute, University of MelbourneZweryfikowany adres z unimelb.edu.au
John-Sebastian EdenSenior Research Fellow; Westmead Institute of Medical Research & University of SydneyZweryfikowany adres z sydney.edu.au
Steven TongPeter Doherty Institute for Infection and ImmunityZweryfikowany adres z mh.org.au

Obserwuj

Sebastian Duchene

Institut Pasteur, Paris, France

Zweryfikowany adres z pasteur.fr - Strona główna

phylogenetics virus evolution computational biology


Tytuł Sortuj wg cytatów Sortuj wg roku Sortuj wg tytułu	Cytowane przez Cytowane przez	Rok
BEAST 2.5: An advanced software platform for Bayesian evolutionary analysis R Bouckaert, TG Vaughan, J Barido-Sottani, S Duchêne, M Fourment, ... PLoS computational biology 15 (4), e1006650, 2019	3580	2019
Neanderthal behaviour, diet, and disease inferred from ancient DNA in dental calculus LS Weyrich, S Duchene, J Soubrier, L Arriola, B Llamas, J Breen, ... Nature 544 (7650), 357-361, 2017	595	2017
Temporal signal and the phylodynamic threshold of SARS-CoV-2 S Duchene, L Featherstone, M Haritopoulou-Sinanidou, A Rambaut, ... Virus Evolution, 2020	435	2020
Molecular‐clock methods for estimating evolutionary rates and timescales SYW Ho, S Duchêne Molecular ecology 23 (24), 5947-5965, 2014	394	2014
Distinct evolutionary dynamics of horizontal gene transfer in drug resistant and virulent clones of Klebsiella pneumoniae KL Wyres, RR Wick, LM Judd, R Froumine, A Tokolyi, CL Gorrie, ... PLoS genetics 15 (4), e1008114, 2019	323	2019
Genome-scale rates of evolutionary change in bacteria S Duchêne, KE Holt, FX Weill, SL Hello, J Hawkey, DJ Edwards, ... Microbial Genomics, 2016	283	2016
Population genomics of hypervirulent Klebsiella pneumoniae clonal-group 23 reveals early emergence and rapid global dissemination MMC Lam, KL Wyres, S Duchêne, RR Wick, LM Judd, YH Gan, CH Hoh, ... Nature communications 9 (1), 2703, 2018	271	2018
Comparative analysis estimates the relative frequencies of co-divergence and cross-species transmission within viral families JL Geoghegan, S Duchêne, EC Holmes PLoS pathogens 13 (2), e1006215, 2017	259	2017
17th Century Variola Virus Reveals the Recent History of Smallpox D Duggan, AT, Perdomo MF, Piombino-Mascali, S Marciniak, D Poinar, ... Current Biology, 2016	258	2016
Large-Scale Phylogenomic Analysis Reveals the Complex Evolutionary History of Rabies Virus in Multiple Carnivore Hosts C Troupin, L Dacheux, M Tanguy, C Sabeta, H Blanc, C Bouchier, ... PLOS Pathogens, 2016	218	2016
Tracking the COVID-19 pandemic in Australia using genomics T Seemann, C Lane, N Sherry, S Duchene, AG da Silva, L Caly, M Sait, ... Nature Communications 11, 4376, 2020	205	2020
Analyses of evolutionary dynamics in viruses are hindered by a time-dependent bias in rate estimates S Duchêne, EC Holmes, SYW Ho Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences 281 (1786), 20140732, 2014	205	2014
Atlas of group A streptococcal vaccine candidates compiled using large-scale comparative genomics MR Davies, L McIntyre, A Mutreja, JA Lacey, JA Lees, RJ Towers, ... Nature genetics 51 (6), 1035-1043, 2019	199	2019
Mitogenome phylogenetics: the impact of using single regions and partitioning schemes on topology, substitution rate and divergence time estimation S Duchêne, FI Archer, J Vilstrup, S Caballero, PA Morin PloS one 6 (11), e27138, 2011	191	2011
The performance of the date-randomization test in phylogenetic analyses of time-structured virus data S Duchêne, D Duchêne, EC Holmes, SYW Ho Molecular Biology and Evolution 32 (7), 1895-1906, 2015	174	2015
Bayesian molecular dating: opening up the black box L Bromham, S Duchêne, X Hua, AM Ritchie, DA Duchêne, SYW Ho Biological Reviews, 2018	161	2018
The impact of calibration and clock-model choice on molecular estimates of divergence times S Duchêne, R Lanfear, SYW Ho Molecular phylogenetics and evolution 78, 277-289, 2014	156	2014
Genomic epidemiology reveals transmission patterns and dynamics of SARS-CoV-2 in Aotearoa New Zealand JL Geoghegan, X Ren, M Storey, J Hadfield, L Jelley, S Jefferies, ... Nature Communications, 2020	149	2020
The molecular clock of Mycobacterium tuberculosis F Menardo, S Duchene, D Brites, S Gagneux Plos Pathogens 15 (19), e1008067, 2019	147	2019
The phylogeography and incidence of multi-drug resistant typhoid fever in sub-Saharan Africa SE Park, DT Pham, C Boinett, VK Wong, GD Pak, U Panzner, ... Nature communications 9 (1), 5094, 2018	127	2018

Nie można teraz wykonać tej operacji. Spróbuj ponownie później.

Prace 1–20

Cytowania rocznie

Powielone cytowania

Scalone cytowania

Dodaj współautorówWspółautorzy

Obserwuj

Cytowane przez

Współautorzy