Niko Välimäki

Geciteerd door

	Alles	Sinds 2019
Citaties	3911	2486
h-index	31	23
i10-index	50	37

440

220

110

330

2008200920102011201220132014201520162017201820192020202120222023202414 25 37 53 90 88 108 129 230 281 322 383 391 427 430 412 439

Openbare toegang

Alles bekijken

39 artikelen

0 artikelen

beschikbaar

niet beschikbaar

Op basis van financieringsmachtigingen

Medeauteurs

Veli MäkinenProfessor of Computer Science, University of HelsinkiGeverifieerd e-mailadres voor helsinki.fi
Kimmo PalinCancer Researcher, Research Program in Cancer Research, Univeristy of HelsinkiGeverifieerd e-mailadres voor helsinki.fi
Jouni SirénUC Santa Cruz Genomics InstituteGeverifieerd e-mailadres voor ucsc.edu
Esa PitkänenInstitute for Molecular Medicine Finland (FIMM), University of HelsinkiGeverifieerd e-mailadres voor helsinki.fi
Gonzalo NavarroUniversity of ChileGeverifieerd e-mailadres voor dcc.uchile.cl
Outi KilpivaaraUniversity of Helsinki, Memorial Sloan-Kettering Cancer CenterGeverifieerd e-mailadres voor helsinki.fi
Jussi TaipaleUniversity of CambridgeGeverifieerd e-mailadres voor sanger.ac.uk
Antti HonkelaProfessor, University of HelsinkiGeverifieerd e-mailadres voor helsinki.fi
Wolfgang GerlachNetAppGeverifieerd e-mailadres voor netapp.com
Leena SalmelaUniversity of HelsinkiGeverifieerd e-mailadres voor cs.helsinki.fi
John A LeesEMBL-EBIGeverifieerd e-mailadres voor ebi.ac.uk
Johannes FischerTU DortmundGeverifieerd e-mailadres voor cs.tu-dortmund.de
Diego ArroyueloDepartment of Computer Science, Escuela de Ingeniería, Pontificia Universidad Católica de ChileGeverifieerd e-mailadres voor uc.cl
Sebastian ManethProfessor für Informatik, Universität BremenGeverifieerd e-mailadres voor uni-bremen.de
Susana LadraUniversity of A Coruña, Centro de investigación CITICGeverifieerd e-mailadres voor udc.es
Kim NguyenAssistant Professor of Computer Science, Université Paris-Sud, FranceGeverifieerd e-mailadres voor lri.fr
Sohan SethLead Data Scientist, University of EdinburghGeverifieerd e-mailadres voor ed.ac.uk
Lu ChengInstitute of Biomedicine, University of Eastern Finland, FinlandGeverifieerd e-mailadres voor aalto.fi
Juha KärkkäinenDepartment of Computer scienceGeverifieerd e-mailadres voor cs.helsinki.fi
Simon GogKarlsruhe Institute of TechnologyGeverifieerd e-mailadres voor kit.edu

Volgen

Niko Välimäki

Postdoctoral researcher, University of Helsinki

Geverifieerd e-mailadres voor cs.helsinki.fi - Homepage

compressed data structures combinatorial algorithms for sequence analysis


Titel Sorteren op citaties Sorteren op jaar Sorteren op titel	Geciteerd door Geciteerd door	Jaar
CTCF/cohesin-binding sites are frequently mutated in cancer R Katainen, K Dave, E Pitkänen, K Palin, T Kivioja, N Välimäki, AE Gylfe, ... Nature genetics 47 (7), 818-821, 2015	475	2015
Indexing graphs for path queries with applications in genome research J Sirén, N Välimäki, V Mäkinen IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics 11 (2 …, 2014	308	2014
Storage and retrieval of highly repetitive sequence collections V Mäkinen, G Navarro, J Sirén, N Välimäki Journal of Computational Biology 17 (3), 281-308, 2010	250	2010
The Glanville fritillary genome retains an ancient karyotype and reveals selective chromosomal fusions in Lepidoptera V Ahola, R Lehtonen, P Somervuo, L Salmela, P Koskinen, P Rastas, ... Nature communications 5 (1), 4737, 2014	243	2014
Sequence element enrichment analysis to determine the genetic basis of bacterial phenotypes JA Lees, M Vehkala, N Välimäki, SR Harris, C Chewapreecha, ... Nature communications 7 (1), 12797, 2016	224	2016
Combined analysis of variation in core, accessory and regulatory genome regions provides a super-resolution view into the evolution of bacterial populations A McNally, Y Oren, D Kelly, B Pascoe, S Dunn, T Sreecharan, M Vehkala, ... PLoS genetics 12 (9), e1006280, 2016	203	2016
Global and regional dissemination and evolution of Burkholderia pseudomallei C Chewapreecha, MTG Holden, M Vehkala, N Välimäki, Z Yang, ... Nature microbiology 2 (4), 1-8, 2017	172	2017
Genomic signatures of human and animal disease in the zoonotic pathogen Streptococcus suis LA Weinert, RR Chaudhuri, J Wang, SE Peters, J Corander, T Jombart, ... Nature communications 6 (1), 6740, 2015	154	2015
Genetic and epigenetic characteristics of inflammatory bowel Disease–Associated colorectal cancer K Rajamäki, A Taira, R Katainen, N Välimäki, A Kuosmanen, RM Plaketti, ... Gastroenterology 161 (2), 592-607, 2021	137	2021
Whole-genome sequencing of growth hormone (GH)-secreting pituitary adenomas N Välimäki, H Demir, E Pitkänen, E Kaasinen, A Karppinen, L Kivipelto, ... The Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism 100 (10), 3918-3927, 2015	102	2015
Fast scaffolding with small independent mixed integer programs L Salmela, V Mäkinen, N Välimäki, J Ylinen, E Ukkonen Bioinformatics 27 (23), 3259-3265, 2011	102	2011
Space-efficient algorithms for document retrieval N Välimäki, V Mäkinen Annual Symposium on Combinatorial Pattern Matching, 205-215, 2007	92	2007
Run-length compressed indexes are superior for highly repetitive sequence collections J Sirén, N Välimäki, V Mäkinen, G Navarro String Processing and Information Retrieval: 15th International Symposium …, 2009	91	2009
Exome-wide somatic mutation characterization of small bowel adenocarcinoma UA Hänninen, R Katainen, T Tanskanen, RM Plaketti, R Laine, ... PLoS genetics 14 (3), e1007200, 2018	82	2018
Genetic predisposition to uterine leiomyoma is determined by loci for genitourinary development and genome stability N Välimäki, H Kuisma, A Pasanen, O Heikinheimo, J Sjöberg, R Bützow, ... Elife 7, e37110, 2018	80	2018
Retrotransposon insertions can initiate colorectal cancer and are associated with poor survival T Cajuso, P Sulo, T Tanskanen, R Katainen, A Taira, UA Hänninen, ... Nature communications 10 (1), 4022, 2019	75	2019
Deficient H2A. Z deposition is associated with genesis of uterine leiomyoma DG Berta, H Kuisma, N Välimäki, M Räisänen, M Jäntti, A Pasanen, ... Nature 596 (7872), 398-403, 2021	72	2021
Frequent L1 retrotranspositions originating from TTC28 in colorectal cancer E Pitkänen, T Cajuso, R Katainen, E Kaasinen, N Välimäki, K Palin, ... Oncotarget 5 (3), 853, 2014	67	2014
Storage and retrieval of individual genomes V Mäkinen, G Navarro, J Sirén, N Välimäki Research in Computational Molecular Biology: 13th Annual International …, 2009	63	2009
Fast in-memory XPath search using compressed indexes D Arroyuelo, F Claude, S Maneth, V Maakinen, G Navarro, K Nguyên, ... Data Engineering (ICDE), 2010 IEEE 26th International Conference on, 417-428, 2010	56*	2010

Het systeem kan de bewerking nu niet uitvoeren. Probeer het later opnieuw.

Artikelen 1–20

Citaties per jaar

Dubbele citaties

Samengevoegde citaties

Medeauteurs toevoegenMedeauteurs

Volgen

Geciteerd door

Medeauteurs