Luca Ponzoni

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Coautores

Ivet BaharDirector, Laufer Center for Physical & Quantitative Biology, Stony Brook UniversityDirección de correo verificada de pitt.edu
Cristian MichelettiSISSADirección de correo verificada de sissa.it
Vincenzo CarnevaleiGEM & ICMS - Temple UniversityDirección de correo verificada de temple.edu
Guido PollesSISSADirección de correo verificada de sissa.it
Mary Hongying ChengDepartment of Computational & Systems BiologyDirección de correo verificada de pitt.edu
She ZhangOpenEye, Cadence Molecular SciencesDirección de correo verificada de eyesopen.com
Daniele GranataSpecialist Scientist at Molecular Modelling and Design (MMD) Department, Novo Nordisk, DenmarkDirección de correo verificada de novonordisk.com
Laura ShubBioinformatics PhD Candidate, UCSFDirección de correo verificada de ucsf.edu
Michael J KeiserAssociate Professor, UCSFDirección de correo verificada de ucsf.edu
Alexandre Victor FassioFederal University of Minas GeraisDirección de correo verificada de ufmg.br
Giorgio ColomboUniversity of PaviaDirección de correo verificada de unipv.it
Antonella PaladinoCNR-IBBDirección de correo verificada de cnr.it
Giulia RossettiFZJ and RWTH UKADirección de correo verificada de fz-juelich.de
Paolo CarloniForschungszentrum JülichDirección de correo verificada de fz-juelich.de
Alejandro GiorgettiFull professor, Biochemistry, University of VeronaDirección de correo verificada de univr.it
Luca MaggiInstitute for Research in Biomedicine (IRB), BarcelonaDirección de correo verificada de irbbarcelona.org
JI YOUNG LEEStony Brook UniversityDirección de correo verificada de stonybrook.edu
Fausto BorgonoviDipartimento di Matematica e Fisica Università CattolicaDirección de correo verificada de unicatt.it
Giuseppe Luca CelardoDepartment of Physics and Astronomy, Universita' degli Studi di Firenze, ItalyDirección de correo verificada de unifi.it
Lev KaplanProfessor of Physics, Tulane UniversityDirección de correo verificada de tulane.edu

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drug discovery molecular modeling protein dynamics deep learning


Título Ordenar por citas Ordenar por año Ordenar por título	Citado por Citado por	Año
Structural dynamics is a determinant of the functional significance of missense variants L Ponzoni, I Bahar Biophysical Journal 114 (3), 232a, 2018	92	2018
Rhapsody: predicting the pathogenicity of human missense variants L Ponzoni, DA Peñaherrera, ZN Oltvai, I Bahar Bioinformatics 36 (10), 3084-3092, 2020	89	2020
SPECTRUS: A dimensionality reduction approach for identifying dynamical domains in protein complexes from limited structural datasets L Ponzoni, G Polles, V Carnevale, C Micheletti Structure 23 (8), 1516-1525, 2015	45	2015
Patterns of coevolving amino acids unveil structural and dynamical domains D Granata, L Ponzoni, C Micheletti, V Carnevale Proceedings of the National Academy of Sciences 114 (50), E10612-E10621, 2017	40	2017
Shared dynamics of LeuT superfamily members and allosteric differentiation by structural irregularities and multimerization L Ponzoni, S Zhang, MH Cheng, I Bahar Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences 373 …, 2018	28	2018
Prioritizing virtual screening with interpretable interaction fingerprints AV Fassio, L Shub, L Ponzoni, J McKinley, MJ O’Meara, RS Ferreira, ... Journal of Chemical Information and Modeling 62 (18), 4300-4318, 2022	26	2022
EIF3H orchestrates Hippo pathway–mediated oncogenesis via catalytic control of YAP stability Z Zhou, H Zhou, L Ponzoni, A Luo, R Zhu, M He, Y Huang, KL Guan, ... Cancer research 80 (12), 2550-2563, 2020	26	2020
The interplay between structural stability and plasticity determines mutation profiles and chaperone dependence in protein kinases A Paladino, F Marchetti, L Ponzoni, G Colombo Journal of Chemical Theory and Computation 14 (2), 1059-1070, 2018	15	2018
Trimerization of dopamine transporter triggered by AIM-100 binding: Molecular mechanism and effect of mutations MH Cheng, L Ponzoni, T Sorkina, JY Lee, S Zhang, A Sorkin, I Bahar Neuropharmacology 161, 107676, 2019	14	2019
Unifying view of mechanical and functional hotspots across class A GPCRs L Ponzoni, G Rossetti, L Maggi, A Giorgetti, P Carloni, C Micheletti PLoS computational biology 13 (2), e1005381, 2017	14	2017
Complementary computational and experimental evaluation of missense variants in the ROMK potassium channel L Ponzoni, NH Nguyen, I Bahar, JL Brodsky PLoS Computational Biology 16 (4), e1007749, 2020	9	2020
Rhapsody: Pathogenicity prediction of human missense variants based on protein sequence, structure and dynamics L Ponzoni, ZN Oltvai, I Bahar bioRxiv, 737429, 2019	3	2019
Focusing in multiwell potentials: applications to ion channels L Ponzoni, GL Celardo, F Borgonovi, L Kaplan, A Kargol Physical Review E—Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics 87 (5 …, 2013	3	2013
From Sequence to Function: Coevolving Amino Acids Encode Structural and Functional Domains D Granata, L Ponzoni, C Micheletti, V Carnevale bioRxiv, 109397, 2017		2017
Knowledge-based identification of functional domains in proteins L Ponzoni SISSA, 2016		2016
A general approach to identify innate dynamical domains in proteins from limited structural datasets L Ponzoni, G Polles, V Carnevale, C Micheletti EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS 44, S61-S61, 2015		2015
Focusing in Multi-Well Potentials: Application to Ion Channels F Borgonovi, GL Celardo, L Ponzoni

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