Fabio Pietrucci

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Coautores

Antonino Marco SaittaFull Professor - Director of the Institute for Mineralogy, Physics of Materials and CosmochemistryDirección de correo verificada de upmc.fr
Alessandro LaioSISSADirección de correo verificada de sissa.it
Wanda AndreoniProfessor of PhysicsDirección de correo verificada de epfl.ch
Fabrizio MarinelliAssistant Professor (Promoted Associate Prof effective July 2025), Medical College of Wisconsin, USADirección de correo verificada de mcw.edu
Marco BernasconiUniversity of Milano-BicoccaDirección de correo verificada de unimib.it
michele parrinelloDepartment of ChemistryDirección de correo verificada de phys.chem.ethz.ch
Carlo CamilloniUniversity of MilanoDirección de correo verificada de unimi.it
Pilar CossioFlatiron InstituteDirección de correo verificada de flatironinstitute.org
Davide BranduardiComputational Chemistry & Informatics Group at AstexDirección de correo verificada de astx.com
Franz SaijaSenior Researcher - National Research Council (CNR), ItalyDirección de correo verificada de cnr.it
Francois GUYOTMuséum National d'Histoire Naturelle. ParisDirección de correo verificada de mnhn.fr
Giovanni BussiScuola Internazionale Superiore di Studi Avanzati, Trieste, ItalyDirección de correo verificada de sissa.it
Massimiliano BonomiInstitut Pasteur, CNRSDirección de correo verificada de pasteur.fr
Davide DonadioUniversity of California DavisDirección de correo verificada de ucdavis.edu
Professor Paolo Raiteri, PhDCurtin UniversityDirección de correo verificada de curtin.edu.au
Giuseppe CassoneResearcher, National Research CouncilDirección de correo verificada de ipcf.cnr.it
Xevi BiarnésAssociate Professor, IQS School of Engineering, Universitat Ramon LlullDirección de correo verificada de iqs.url.edu
Andrea Pérez-VillaBayer SASDirección de correo verificada de bayer.com
Martin FerusJ.Heyrovsky Institute of Physical Chemistry, Czech Academy of SciencesDirección de correo verificada de jh-inst.cas.cz
Fahimeh BaftizadehAllen InstituteDirección de correo verificada de alleninstitute.org

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Fabio Pietrucci

associate professor (maître de conférences, HDR), Sorbonne Université

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molecular dynamics free-energy calculations materials science computational chemistry biophysics


Título Ordenar por citas Ordenar por año Ordenar por título	Citado por Citado por	Año
PLUMED: A portable plugin for free-energy calculations with molecular dynamics M Bonomi, D Branduardi, G Bussi, C Camilloni, D Provasi, P Raiteri, ... Computer Physics Communications 180 (10), 1961-1972, 2009	1826	2009
Promoting transparency and reproducibility in enhanced molecular simulations M Bonomi, G Bussi, C Camilloni, GA Tribello, P Banáš, A Barducci, ... Nature methods 16 (8), 670-673, 2019	772	2019
A kinetic model of trp-cage folding from multiple biased molecular dynamics simulations F Marinelli, F Pietrucci, A Laio, S Piana PLoS computational biology 5 (8), e1000452, 2009	328	2009
A collective variable for the efficient exploration of protein beta-sheet structures: Application to SH3 and GB1 F Pietrucci, A Laio Journal of Chemical Theory and Computation 5, 2197, 2009	186	2009
Formation of nucleobases in a Miller–Urey reducing atmosphere M Ferus, F Pietrucci, AM Saitta, A Knížek, P Kubelík, O Ivanek, ... Proceedings of the National Academy of Sciences 114 (17), 4306-4311, 2017	183	2017
Ab initio study of the vibrational properties of crystalline TeO 2: The α, β, and γ phases M Ceriotti, F Pietrucci, M Bernasconi Physical Review B 73 (10), 104304, 2006	182	2006
Machine learning force fields and coarse-grained variables in molecular dynamics: application to materials and biological systems P Gkeka, G Stoltz, A Barati Farimani, Z Belkacemi, M Ceriotti, JD Chodera, ... Journal of Chemical Theory and Computation 16 (8), 4757-4775, 2020	178	2020
Strategies for the exploration of free energy landscapes: unity in diversity and challenges ahead F Pietrucci Reviews in Physics 2, 32-45, 2017	171	2017
Substrate binding mechanism of HIV-1 protease from explicit-solvent atomistic simulations F Pietrucci, F Marinelli, P Carloni, A Laio Journal of the American Chemical Society 131, 11811, 2009	167	2009
Graph theory meets ab initio molecular dynamics: Atomic structures and transformations at the nanoscale F Pietrucci, W Andreoni Physical Review Letters 107 (8), 085504, 2011	165	2011
Formamide reaction network in gas phase and solution via a unified theoretical approach: Toward a reconciliation of different prebiotic scenarios F Pietrucci, AM Saitta Proceedings of the National Academy of Sciences 112 (49), 15030-15035, 2015	146	2015
Metadynamics convergence law in a multidimensional system Y Crespo, F Marinelli, F Pietrucci, A Laio Physical Review E 81 (5), 055701, 2010	108	2010
Vacancy-vacancy interaction and oxygen diffusion in stabilized cubic ZrO 2 from first principles F Pietrucci, M Bernasconi, A Laio, M Parrinello Physical Review B 78 (9), 094301, 2008	101	2008
METAGUI. A VMD interface for analyzing metadynamics and molecular dynamics simulations X Biarnés, F Pietrucci, F Marinelli, A Laio Computer Physics Communications 183 (1), 203-211, 2012	98	2012
Multidimensional View of Amyloid Fibril Nucleation in Atomistic Detail F Baftizadeh, X Biarnes, F Pietrucci, F Affinito, A Laio Journal of the American Chemical Society 134 (8), 3886-3894, 2012	94	2012
Ab initio study of yttria-stabilized cubic zirconia surfaces G Ballabio, M Bernasconi, F Pietrucci, S Serra Physical Review B 70 (7), 075417, 2004	79	2004
Exploring the universe of protein structures beyond the Protein Data Bank P Cossio, A Trovato, F Pietrucci, F Seno, A Maritan, A Laio PLoS computational biology 6 (11), e1000957, 2010	77	2010
Pre-critical fluctuations and what they disclose about heterogeneous crystal nucleation M Fitzner, GC Sosso, F Pietrucci, S Pipolo, A Michaelides Nature communications 8 (1), 2257, 2017	76	2017
Capture and Release of CO2 in Monoethanolamine Aqueous Solutions: New Insights from First-Principles Reaction Dynamics C Ma, F Pietrucci, W Andreoni Journal of chemical theory and computation 11 (7), 3189-3198, 2015	76	2015
HAL-Muséum National d'Histoire Naturelle G Cassone, F Pietrucci, F Saija, F Guyot, J Sponer	73*

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