| Bulgaristan’da Osmanlı Maddi Kültür Mirasının Tasfiyesi (1878-1908)= Elimination of the Ottoman Material Cultural Heritage in Bulgaria (1878-1908) A Koyuncu OTAM Ankara Üniversitesi Osmanlı Tarihi Araştırma ve Uygulama Merkezi …, 2006 | 45 | 2006 |
| Tuna Vilâyeti’nde Nüfus ve Demografi (1864-1877) A Koyuncu Turkish Studies 9 (4), 2014 | 41 | 2014 |
| Osmanlı Devleti’nde Kilise ve Havra Politikasına Yeni Bir Bakış: Çanakkale Örneği A Koyuncu Çanakkale Araştırmaları Türk Yıllığı 12 (16), 35-88, 2014 | 40 | 2014 |
| Bulgar Eksarhlığı A Koyuncu Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, Sosyal Bilimler Enstitüsü, Yüksek …, 1998 | 29 | 1998 |
| Balkan Savaşları Sırasında Pomakların Zorla Tanassur Edilmesi (1912-1913) A Koyuncu Osmanlı Tarihi Araştırma ve Uygulama Merkezi Dergisi OTAM, 139-196, 2013 | 25 | 2013 |
| 1877-1878 Osmanlı-Rus Harbi Öncesinde Şarkî Rumeli Nüfusu A Koyuncu Avrasya Etüdleri 19 (44), 177-208, 2013 | 22 | 2013 |
| Yunanistan'da Bağımsız Devlet A Koyuncu Balkanlar El Kitabı, 1, 473-497, 2013 | 15* | 2013 |
| Yunanistan’da Bağımsız Devlet A Koyuncu Balkanlar El Kitabı 1, 488-514, 2006 | 15 | 2006 |
| Osmanlı Kimliği Üzerine Bazı Düşünceler A Koyuncu HÜTAD 1 (1), 203-212, 2005 | 15 | 2005 |
| Devşirme Tarihine Bir Derkenar: Bosna'nın İslamlaşması ve Osmanlı Terminolojisinde Potur ve Potur Oğulları Terimlerinin Anlamı A Koyuncu Türk Sosyal Tarihçiliğinde Bir "Yalnız" İsim Bahaeddin Yediyıldız'a Armağan …, 2015 | 10 | 2015 |
| Tanzimat Dönemi Eğitim Reformları Işığında Çanakkale'de Gayrimüslim ve Ecnebi Mektepleri A Koyuncu Çanakkale Araştırmaları Türk Yıllığı 11 (15), 77-127, 2013 | 9 | 2013 |
| Sofya’da Osmanlı Mimari Mirasının Tasfiyesi (1878-1908) A Koyuncu XVI. Türk Tarih Kongresi: Ankara: 20-24 Eylül 2010, Kongreye Sunulan …, 2015 | 7 | 2015 |
| Balkanlarda Dönüşüm, Milli Devletler ve Osmanlı Mirasının Tasfiyesi: Bulgaristan Örneği (1878-1913) A Koyuncu Hacettepe Üniversitesi, Sosyal Bilimler Enstitüsü, Tarih Anabilim Dalı …, 2005 | 6* | 2005 |
| Kavânîn-i Yeniçeriyân ve Bosnalı Müslüman Çocuklarının Devşirilmesi Meselesinin Tenkidi A Koyuncu Uluslararası Balkan Tarihi ve Kültürü Sempozyumu, 6-8, 2017 | 5 | 2017 |
| Sofya’daki Sofu Mehmed Paşa Camisi (Kara Cami)’nin Kiliseye Dönüştürülmesi A Koyuncu Uluslararası Balkanlarda Türk Varlığı Sempozyumu - II, Bildiriler 2, 129-146, 2010 | 5 | 2010 |
| Çanakkale Savaşları Bibliyografyası A Koyuncu, Ö Keskin, CS Sönmez Atatürk Araştırma Merkezi, 2010 | 5 | 2010 |
| Bulgaristan’dan Göç ve Türk Varlıklarının Tasfiyesi (1877-1908) A Koyuncu Balkanlar ve Göç (The Balkans and Mass Immigration), 525-558, 2013 | 4 | 2013 |
| YANGINLAR, KİLİSELER VE HAVRALAR: OSMANLI DÖNEMİNDE SARAYBOSNA’DA GAYRİMÜSLİM MABETLERİNİN MEŞRULAŞMA SÜRECİ A Koyuncu Balkan Araştırma Enstitüsü Dergisi-Trakya Üniversitesi 10 (1), 179-220, 2021 | 2 | 2021 |
| Osmanlı Dönemi'nde Saraybosna Yangınları (1697-1878) A Koyuncu Cihannüma Tarih ve Coğrafya Araştırmaları Dergisi 6 (2), 47-94, 2020 | 1 | 2020 |
| Balkanlarda Kültürel Değişim: Bulgaristan Örneği (1878-1913) A Koyuncu Avrasya Etüdleri, 47-74, 2003 | 1 | 2003 |
